Padronização da Técnica RT-qPCR para detecção de Arbovírus em amostras de tecidos parafinados
DOI:
https://doi.org/10.18593/evid.32787Palavras-chave:
Arbovírus, RT-qPCR, Tecidos Parafinados, Vigilância Epidemiológica, Diagnóstico DiferencialResumo
Arbovírus são transmitidos por mosquitos e carrapatos, causando doenças graves em humanos, como dengue, Zika, Chikungunya e febre amarela. Este estudo buscou padronizar a técnica de RT-qPCR para detecção desses vírus em amostras de tecidos parafinados. Foram utilizadas 45 amostras parafinadas, incluindo arbovírus em estudo e amostras de controle negativo, provenientes de diferentes períodos e tecidos, catalogadas pelo Instituto Evandro Chagas. A padronização da técnica de RT-qPCR é essencial para a vigilância epidemiológica de arbovírus na região amazônica e no Brasil. Os resultados demonstraram eficiência na detecção e quantificação do genoma viral dos diferentes arbovírus. A técnica de RT-qPCR se mostrou uma ferramenta importante para o diagnóstico diferencial em amostras de tecidos parafinados. Essa padronização é relevante para o monitoramento e controle efetivo das doenças transmitidas por arbovírus, contribuindo para a saúde pública e a prevenção de surtos. Este estudo ressalta a importância da padronização da técnica de RT-qPCR para detecção de arbovírus em amostras de tecidos parafinados. A região amazônica e o Brasil são áreas propensas a surtos dessas doenças, tornando esses avanços ainda mais significativos. A detecção precoce e precisa dos arbovírus permite a implementação de medidas de controle e prevenção mais eficazes, além de contribuir para a compreensão da epidemiologia dessas doenças.
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Referências
Guzman MG, Harris E. Dengue. Lancet. 2015 Jan 31;385(9966):453-65.
Thammasonthijarern N, Puangmanee W, Sriburin P, Injampa S, Chatchen S, Phumirattanaprapin W, et al. Human Heavy Chain Antibody Genes Elicited in Thai Dengue Patients during DENV2 Secondary Infection. Jpn J Infect Dis. 2020 Mar 24;73(2):140-7.
Vicenti I, Dragoni F, Giannini A, Giammarino F, Spinicci M, Saladini F, et al. Development of a Cell-Based Immunodetection Assay for Simultaneous Screening of Antiviral Compounds Inhibiting Zika and Dengue Virus Replication. SLAS Discov. 2020 Jun;25(5):506-14.
Zhou Y, Mammen MP, Klungthong C, Chinnawirotpisan P, Vaughn DW, Nimmannitya S, et al. Comparative analysis reveals no consistent association between the secondary structure of the 3’-untranslated region of dengue viruses and disease syndrome. J Gen Virol. 2006 Sep;87(Pt 9):2595-603.
Sam S-S, Omar SFS, Teoh B-T, Abd-Jamil J, AbuBakar S. Review of Dengue hemorrhagic fever fatal cases seen among adults: a retrospective study. PLoS Negl Trop Dis. 2013 May 2;7(5):e2194.
Araújo PA, Freitas MO, Chiang JO, Silva FA, Chagas LL, Casseb SM, et al. Investigation about the Occurrence of Transmission Cycles of Arbovirus in the Tropical Forest, Amazon Region. Viruses. 2019 Aug 22;11(9).
Lopez-Jimena B, Bakheit M, Bekaert M, Harold G, Frischmann S, Fall C, et al. Development and Validation of Real-Time RT-LAMP Assays for the Specific Detection of Zika Virus. Methods Mol Biol. 2020;2142:147-64.
Thompson R, Martin Del Campo J, Constenla D. A review of the economic evidence of Aedes-borne arboviruses and Aedes-borne arboviral disease prevention and control strategies. Expert Rev Vaccines. 2020 Feb;19(2):143-62.
Reed LJ, Muench H. A simple method of estimating fifty per cent endpoints. Am J Epidemiol. 1938 May;27(3):493-7.
Johnson BW, Russell BJ, Lanciotti RS. Serotype-specific detection of dengue viruses in a fourplex real-time reverse transcriptase PCR assay. J Clin Microbiol. 2005 Oct;43(10):4977-83.
Gustafsson RKL, Engdahl EE, Fogdell-Hahn A. Development and validation of a Q-PCR based TCID50 method for human herpesvirus 6. Virol J. 2012 Dec 18;9:311.
Jonsson N, Gullberg M, Lindberg AM. Real-time polymerase chain reaction as a rapid and efficient alternative to estimation of picornavirus titers by tissue culture infectious dose 50% or plaque forming units. Microbiol Immunol. 2008 Dec 18;53(3):149-54.
Guerra MJ, Ferreira CSS, Beraldo KRF, Kimura LM, Takahashi JPF, Salas-Gómez D, et al. One-step Multiplex Real-time RT-PCR for Molecular Detection and Typing of Dengue Virus Infection From Paraffin-embedded Tissues During the Brazilian 2019 Outbreak. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2021 Feb 1;29(2):158-62.
Corchuelo S, Gómez CY, Rosales AA, Santamaria G, Rivera JA, Saad EP, et al. CISH and IHC for the Simultaneous Detection of ZIKV RNA and Antigens in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Cell Blocks and Tissues. Curr Protoc. 2021 Dec;1(12):e319.
Reagan-Steiner S, Simeone R, Simon E, Bhatnagar J, Oduyebo T, Free R, et al. Evaluation of Placental and Fetal Tissue Specimens for Zika Virus Infection – 50 States and District of Columbia, January-December, 2016. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2017 Jun 23;66(24):636-43.
Domingo C, Patel P, Yillah J, Weidmann M, Méndez JA, Nakouné ER, et al. Advanced yellow fever virus genome detection in point-of-care facilities and reference laboratories. J Clin Microbiol. 2012 Dec;50(12):4054-60.
Silva LA, Dermody TS. Chikungunya virus: epidemiology, replication, disease mechanisms, and prospective intervention strategies. J Clin Invest. 2017 Mar 1;127(3):737-49.
Pialoux G, Gaüzère B-A, Jauréguiberry S, Strobel M. Chikungunya, an epidemic arbovirosis. Lancet Infect Dis. 2007 May;7(5):319-27.
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